Limousine se stane lídrem budoucí genomiky

S každým novým vzorkem zaslaným do laboratoře imunogenetiky k ověření původu přes novou metodu SNP se dostáváme blíže k rozjezdu domácího výpočtu genomických plemenných hodnot (GEPH). Hlavním předpokladem k tomu je vytvoření dostatečně velké referenční populace. Ta musí obsahovat nejenom data od mladých zvířat, ale také takových, která populaci dostatečně propojí – většinou tedy starších a nepříbuzných zvířat, která z pohledu ověření původu nejsou pro jednotlivé chovatele příliš zajímavá a zpravidla by se jimi ze své vlastní iniciativy nezabývali. Prvním plemenem, které se k hromadnému testování těchto zvířat přihlásilo, se stalo limousine. Aby nezůstalo pouze u slovní proklamace, je nutné učinit co nejrychleji praktické kroky. Jak na to napoví tento článek.

1. Jaká zvířata bude nutné natestovat?

K orientaci chovatelů, která zvířata je nutné znovu přetestovat na čipu (metodou SNP), jsme připravili přiložený seznam obsahující 645 zvířat plemene limousine. Přehled je setříděn dle majitelů a obsahuje všechny dostupné údaje, které u zvířat evidujeme. Předposlední sloupec obsahuje číslo udávající prioritu od nejvyšší (1) až po nežijící zvířata (4).

1 - zvířata s nejvyšší prioritou, většinou žijící - velmi dobře propojující, včetně importů býků

2 - zvířata pro propojení všech chovů v KUMP

3 - býci používaní v KUMP s nižší spolehlivostí

4 - nežijící zvířata, nejcennější pro tvorbu báze - u býků lze řešit přes ID (pokud jsou dostupné)

Primárně se proto, prosím, zaměřte na odebrání vzorku a natestování zvířat s číslem 1 a 2 (popř. 3, pokud chcete býka prodat nebo vyřadit), inseminační firmy nechť pozornost soustředí na zvířata s prioritou 4. Uvědomujeme si, že seznam je poměrně obsáhlý, ale čím dříve se podaří získat data od většiny těchto jedinců, tím dříve budeme schopnosti s výpočtem odhadu GEPH začít.

Seznam vybraných limousinských zvířat pro potřeby vytvoření referenční populace pro budoucí odhad GEPH najdete ZDE (xls soubor). Odkaz na soubor je k dispozici rovněž v sekci v části plemena/limousine/klubové zápisy.

2. Co pro to musím udělat?

Vše je stejné jako v případě obvyklého objednávání ověření původu – tedy odebrat co nejkvalitnější vzorek, odeslat jej do laboratoře imunogenetiky ČMSCH a.s. a na webu igenetika.cz vyplnit objednávku. Při volbě objednávky zvolte položku testace ČSCHMS. Pokud zvolíte tento typ objednávky i u zvířat, která nejsou na seznamu uvedena, bude testace provedena, ale plně na náklady objednatele.

3. Co mě to bude stát?

Cena je identická jako v případě "klasickéů testace – tedy 1.050 Kč bez DPH. Pokud ale při objednávce zvolíte službu testace ČSCHMS, bude cena naúčtována našemu svazu. Vzhledem k tomu, že jde o poměrně významný objem financí, bylo na posledním jednání Klubu chovatelů plemene limousine dohodnuto, že jednotliví chovatelé se na těchto nákladech budou podílet částkou 150 Kč/ks, které jim budou přefakturovány (zápis s rozhodnutím ke stažení zde). Zbytek nákladů bude hrazen z rozpočtu ČSCHMS resp. část nákladů bude kompenzována (pokryta) dotací ze strany státu.

4. Je nutné znovu testovat zvířata již dříve otestovaná?

Ano. Mnoho zvířat uvedených na seznamu má sice z minulosti DNA profil hotový, byl ale získán testací DNA provedenou přes mikrosatelity a tento způsob ověřování nelze k tomuto účelu použít. Je tedy nutné znovu odebrat vzorek a zvíře otestovat na čipu (viz bod 2.).

5. Proč se toto všechno vlastně dělá?

Genomické plemenné hodnoty patří dnes k mezinárodnímu standardu při genetickém hodnocení zvířat. Chce-li Česká republika držet krok s chovatelsky vyspělými zeměmi a má-li být i do budoucna konkurenceschopná při prodeji plemenného skotu, není jiné cesty, než se mezinárodním trendům přizpůsobit. Pokud budeme dlouho váhat a "přešlapovat na místě", budeme se od světových směrů odklánět a zájem o česká plemenná zvířata se bude postupně snižovat.

6.Co se jinam nevešlo, ale je dobré vědět

Přiložený seznam je první verzí, která se bude postupem doby aktualizovat a doplňovat podle toho, kolik zvířat z jaké skupiny se podaří otestovat. Pokud jich bude málo, budeme muset do seznamu zahrnout i nějaké jejich potomky. Odkaz na seznam zvířat však bude zůstávat stále stejný, pouze bude docházet k aktualizaci dat v něm obsažených. Pokud zjistíte nějakou nesrovnalost (např. že označené zvíře jako žijící již nežije), budeme rádi za zpětnou vazbu. Data vychází z databáze KUMP a ne ve všech případech disponujeme od chovatelů zcela aktuálními informacemi.

V případě odborných dotazů a nesrovnalostí u zvířat kontaktujte Alenu Svitákovou na emailu svitakova@cschms.cz, finanční a další dotazy směřujte na Kamila Maláta - malat@cschms.cz.

Autor: Kamil Malát