Možnosti využití Test Day Modelu pro predikci plemenných hodnot

Vít Škaryd, Václav Jakubec

Katedra genetiky a obecné zootechniky, ČZU Praha

Základem šlechtění hospodářských zvířat je genetické ocenění jedince. Na sklonku minulého století se objevil nový přístup ke zpracování údajů kontroly užitkovosti Test Day Model - model kontrolního dne. PTAK and SCHAEFFER (1993) prokázali, že reziduální variance byla menší, pokud jako složený faktor byl uvažován faktor stádo-kontrolní den místo obvyklého faktoru stádo-rok-sezóna. V jejich díle pokračovali mnozí a dnes již máme různě komplikované modely (SWALVE, 1995).

Hodnocený soubor dat (15 724 záznamů) byl získán v rámci rozšířené kontroly užitkovosti ve dvouletém období (1991 - 1993) od 1 044 dojnic (různého pořadí laktace 1-11 a 9-ti plemenných skupin), chovaných v 16 stádech, po 281 plemenících. Měřením byly zjišťovány tyto ukazatele: nádoj mléka v kg - ML, %bílkoviny - B, %tuku - T, %laktózy - L a počet somatických buněk v 1ml mléka v tis. - PSB. K dispozici byly i následující údaje: datum kontrolního dne, datum otelení, datum narození, označení otce a plemenná příslušnost dojnice. Dále byl soubor doplněn o ukazatele: ECM (Energy Corrected Milk) a SCS (Somatic Cell Score).

ECM = ML * (0,25 + 0,122 * T + 0,077 * B)

úprava podle SJAUNJA et al. (1990 - cit. WASSMUTH et al., 1998)

SCS = log2 (PSB/100) + 3

úprava podle ALI et al. (1980)

Na základě shlukové analýzy vytvořit kategorie pro sezónu otelení a interval kontrolního dne. Pro každou kategorii zvlášť odhadnout parametry popisující laktační křivku. Pro odhad bylo použito SAS/STAT (1999) Cluster Analysis procedure a SAS/STAT (1999) Reg procedure.

Image1.jpg

yjklm pozorovaná denní užitkovost;

k kráva, náhodný efekt

l pořadí dnu testu, fixní efekt

j kategorie sezóny otelení a intervalu kontrolního dne, fixní efekt

m pořadí laktace

DIMklm počet dnů v příslušné laktaci, fixní efekt

c délka laktace c = 305

b1-4jm regresní koeficienty pro příslušný sdružený efekt - j * m

ejklm náhodná zbytková chyba zahrnující pevný efekt stádo-kontrolní den, náhodný aditivně-genetický, náhodný permanentní prostřeďový a náhodný zbytkový efekt

upraveno podle DANELL (1982) a SWALVE (1994)

Na základě shlukové analýzy, provedené podle jednotlivých měřených parametrů (ML, B, T, L, PSB) a při splnění požadavku na kompaktnost, byly vytvořeny tři kategorie pro ukazatel intervalu kontrolního dne a to: I - leden až duben, II - květen až srpen a III - září až prosinec. Kategorie pro sezónu otelení se, vzhledem k charakteru pokusu, vytvořit nepodařilo.

Regresní koeficienty pro sdružený efekt pořadí laktace a intervalu kontrolního dne jsou uvedeny v následující tabulce.

Odhadnuté regresní koeficienty - b pro příslušný sdružený efekt

Mléko

m

1

2

3+

j

I - IV

V - VIII

IX - XII

I - IV

V - VIII

IX - XII

I - IV

V - VIII

IX - XII

b1jm

7,66658

8,796943

9,946202

10,09364

9,341499

6,362041

7,76033

8,323533

6,30692

b2jm

1,163944

1,522751

0,368351

-0,03442

1,591969

3,93431

1,863617

3,087297

3,937027

b3jm

13,12486

16,42604

13,0591

16,74776

18,03023

16,70394

18,52394

19,78

18,08791

b4jm

-2,524

-3,70146

-2,4021

-3,27447

-3,63729

-3,31289

-3,77328

-4,11112

-3,62213

ECM

m

1

2

3+

j

I - IV

V - VIII

IX - XII

I - IV

V - VIII

IX - XII

I - IV

V - VIII

IX - XII

b1jm

9,940783

10,53558

12,93969

13,78921

11,24174

9,499044

10,64401

10,82938

9,758201

b2jm

-0,03022

0,552252

-1,54264

-2,52999

0,051063

1,883219

0,301716

1,326123

1,617766

b3jm

12,50566

15,50969

11,98922

15,37701

16,55088

15,50393

17,49154

18,1473

16,6706

b4jm

-2,23638

-3,27086

-1,99283

-2,67282

-3,10428

-2,79522

-3,27966

-3,46311

-3,05333

SCS

m

1

2

3+

j

I - IV

V - VIII

IX - XII

I - IV

V - VIII

IX - XII

I - IV

V - VIII

IX - XII

b1jm

5,070432

5,361759

5,579295

6,791985

6,728818

7,420618

6,806887

8,592309

7,323258

b2jm

-1,53652

-1,74157

-2,06642

-2,49433

-2,37882

-2,85356

-2,40145

-3,85229

-2,7036

b3jm

0,912901

1,282426

0,933938

0,903054

1,445201

1,052002

1,692489

1,023719

1,368545

b4jm

-0,07041

-0,12098

-0,09552

-0,01777

-0,25563

-0,05548

-0,2198

-0,00205

-0,14473

Odhadnuté regresní koeficienty jsou základem pro následné analýzy pomocí Test Day Modelu.

Literatura:

ALI, A. K. A., SHOOK, G. E.: An optimum transformation for somatic cell concetracion in milk. J. Dairy Sci., 63, 1980, 487-490.

DANELL, B.: Studies on lactation yield and individual test-day yields of Swedish dairy cows. Acta Agri Scan. 32, 1982, 84-92.

PTAK, E., SCHAFFER, L.R.: Use of test day yields for genetic evaluation of dairy sires and cows. Livestock Production Science. Amsterdam 34, 1993, 23-34.

SAS/STAT: Users guide (Release 6.11). Sas Inst.,Inc.,Cary, NC, USA, 1999.

SWALWE, H. H.: The effect of test days models on the estimation of genetic parameters and breeding values for dairy yield traits. J. Dairy Sci., 78, 1994, 929-938.

SWALWE, H. H.: Test day models in the analysis of dairy production data - a review J.Archiv Tierzucht, Dummersdorf 38, 1995, 591-612.

WASSMUTH, R., MADSEN, P., BOELLING, D., and JENSEN, J.: Genetic relationships between production traits of growing bulls and disease incidence of lactating heifers. 49th Annual meeting of the E.A.A.P., Warsaw 1998, Paper G2.3.

Tisk

Další články v kategorii

Agris Online

Agris Online

Agris on-line
Papers in Economics and Informatics


Kalendář


Podporujeme utipa.info