Genomická testace se hezky rozjíždí

Ověřování původů přes SNP s tím spojená tvorba databáze pro budoucí odhad genomických plemenných hodnot (GEPH) se pěkně rozjíždí. K dnešnímu dni databáze aktuálně čítá již 2216 zaevidovaných vzorků masného skotu a každý den přibývají další. Potěšitelné je i to, že se chovatelé pěti hlavních masných plemen ztotožnili s myšlenkou co nejrychlejšího vytvoření referenční populace a přesto, že z uvedených více než dvou tisíc vzorků jich je pro tyto účely zatím jen 114, tak i zde každý den přibývají nové. Čím dříve se podaří dát dohromady potřebné množství zvířat, tím dříve budeme schopni nabídnout chovatelům genomické plemenné hodnoty.

Do konce měsíce září, kdy ještě fungoval souběh staré metody (přes mikrosatelity) a nové (SNP čipy), bylo novou SNP metodou analyzováno 453 vzorků. To znamená, že za dva měsíce a pár dní (říjen, listopad a několik prosincových dní) chovatelé masných plemen skotu do laboratoře imunogenetiky ČMSCH a.s. přes aplikaci igenetika.cz zaslali úctyhodných 1763 vzorků. Za tuto aktivitu samozřejmě všem chovatelům děkujeme.

Na seznamech, které jsme pro potřeby referenční populace vytvořili a které byly dnes aktualizovány, je v součtu za všech pět plemen zaneseno více než 5.500 jedinců, což se při aktuálně 114 zaslaných vzorcích může zdát jako kapka v moři. To je sice pravda, ale je nutné si uvědomit, že seznamy jsou v případě plemene limousine zveřejněny teprve necelý měsíc, u ostatních čtyř plemen ještě kratší dobu. Nejvíce vzorků zvířat z těchto seznamů k testaci zatím zaslali "limuzíňáci" (66 otestovaných zvířat), následovaní chovateli charolais, kteří k dnešnímu zaslali 46 vzorků.

Cena SNP testu pro potřeby tvorby referenční populace je identická jako v případě "klasické" testace. Pokud ale při objednávce zvolíte službu testace ČSCHMS, bude cena naúčtována nám resp. majiteli zvířete bude naším svazem přefakturováno z této částky pouze 150 Kč. Na nedávných jednání Klubů chovatelů plemene limousine a charolais bylo totiž jednomyslně chovateli odsouhlaseno, že se na celkových nákladech budou podílet právě částkou 150 Kč/ks. Zbytek nákladů bude hrazen z rozpočtu ČSCHMS resp. část jich bude kompenzována (pokryta) dotací ze strany státu. Neoficiálně se k myšlence finanční spoluúčasti ve výši 150 Kč přidali i chovatelé plemene aberdeen angus.

Abychom podpořili zdravou soutěživost mezi plemeny, budeme do seznamů přidávat informaci o tom, zda zvíře bylo již na čipu otestováno či nikoliv (poslední sloupec – N/A). Upozorňujeme, že seznamy nejsou nijak provázány s aplikací igenetika.cz. Jejich aktualizace probíhá ručně a nejedná se tedy vždy o úplně poslední známý stav. K jakému datu je seznam platný poznáte z jeho popisku (např. stav k 5.12.2018).

Začátkem ledna rovněž přistoupíme k dobropisování části nákladů za testaci SNP zrealizovanou do konce září, což byl datum ke kterému jsme v souladu s dotačními pravidly žádali o dotaci. Vzorky zpracované laboratoří po 1.10.2018 budou zahrnuty do žádosti o dotaci až v září příštího roku a dobropisem řešeny až počátkem roku 2020. Znovu připomínáme, že dobropis bude vystaven pouze těm chovatelům, kteří mají uhrazenu za tuto službu fakturu!

V případě odborných dotazů a nesrovnalostí u zvířat ze seznamů kontaktujte Alenu Svitákovou (email svitakova@cschms.cz), finanční a další dotazy směřujte na Kamila Maláta (email malat@cschms.cz).

Další informace ke genomice a SNP na našem webu:

• Genomika není jen pro vybraná plemena!: ZDE • Charolais se připojí k hromadné testaci pro GEPH: ZDE

• Limousine se stane lídrem budoucí genomiky: ZDE

• Posílejte k testaci kvalitní vzorky, ušetříte peníze: ZDE

• Nový způsob ověřování původu v kostce: ZDE

• Revoluce v ověřování původů se blíží: ZDE

• Požadavky na genotyp SNP ze zahraničí: ZDE

• Nový set k odběru vzorků chlupových cibulek: ZDE

• Ověřování původů přes genotypizaci přichází: ZDE

Autor: Kamil Malát